10月13日,中国科学院生物物理研究所章新政研究组与许瑞明研究组合作,在cell research上在线发表题为structural basis for nucleosome-mediated inhibition of cgas activity的研究论文,解析人源cgas(cyclic gmp-amp synthase)与核小体复合物的冷冻电镜结构,揭示核小体竞争性抑制cgas酶活性的结构基础和作用机制,阐释在细胞核内或特定细胞周期中,cgas不会通过结合自身dsdna引起自身免疫系统攻击的原因。
cgas-sting信号通路是天然免疫系统的组成部分,在对抗外源病原体入侵、细胞损伤等过程中发挥重要作用。cgas通过识别和结合胞质中的外源dsdna或细胞损伤产生的自身dsdna,将底物gtp和atp催化合成信使小分子cgamp(cyclic gmp-amp),cgamp小分子能够结合并活化sting蛋白,从而激活下游免疫信号通路,介导i型干扰素的产生,引发免疫应答。然而,cgas对dna的识别没有序列特异性,因此,cgas如何避免被自身正常dsdna激活是相关领域的研究热点之一。有研究认为,cgas仅存在于胞质中,在特定细胞周期如有丝分裂中核膜破裂将有较多自身dna被释放出来;也有研究认为,细胞核中也有cgas存在,并且富集在染色质区域。但是在上述两种情况中,cgas的酶活性均处于抑制状态。近期有研究表明,核小体可与cgas结合并抑制dsdna介导的cgas激活,而具体的作用机制尚不清楚。
基于此,研究团队开展合作,验证核小体可竞争性与cgas结合并抑制其酶活性,获得两种人源cgas与核小体复合物的冷冻电镜结构,分别以1:1和2:2形式结合(如图)。cgas拥有三个dsdna结合位点(site a/b/c),且三个结合位点均对dsdna介导的cgas激活有重要作用。在人源cgas-核小体复合物结构中,研究发现cgas以单体形式与核小体结合,其结合位点site b与核小体h2a-h2b的酸性界面之间存在相互作用,结合位点site c中的碱性氨基酸残基则可与相邻核小体的dna结合。由于空间位阻效应,cgas的结合位点site a虽然没有直接参与和核小体之间的结合,但是这一区域亦不能被dna靠近结合。因此,核小体与cgas之间的相互作用阻挡cgas与dna间的识别与结合,破坏cgas二聚化,从而将其“绑架”在非激活的单体状态。此外,该研究发现cgas能够与核小体结合形成更高级形式的寡聚体复合物,并获得以4:3比例结合的cgas-核小体复合物电子密度图。该研究通过一系列体外结合实验和酶活性实验,验证核小体抑制cgas激活的关键氨基酸残基,以及介导高级形式复合物形成的相互作用区域。
生物物理所研究员章新政和许瑞明为论文共同通讯作者,章新政研究组副研究员曹端方、许瑞明研究组后韩晓楠和章新政研究组范晓益为论文共同第一作者。研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、中科院战略性先导科技专项和中科院青年创新促进会的支持。
人源cgas与核小体复合物的冷冻电镜结构示意图