上海巴斯德所发表深浅海软甲纲动物比较病毒组学分析成果 -凯发k8国际首页登录

　　9月16日，中国科学院上海巴斯德研究所崔杰研究组在国际期刊《科学通报》（ bulletin）上在线发表了最新研究成果。

　　深海具有光照少、盐度高等独特的理化性质，是不利于生物生存的极端恶劣环境。由于采样困难，人们对于深海的研究较为局限，而对深海病毒的种类更是知之甚少。在这项工作中，崔杰团队对“科学”号科考船在深海冷泉区采集到的一种虾类（潜铠虾，shinkaia crosnieri，生活在水下1100米处）开展了病毒组学研究，以了解深海生物的病毒组组成。为了比较深海、浅海生物病毒组成的差异，研究团队还分析了浅海软甲纲动物（虾、蟹等）病毒组，完善和补充了人们对于海洋病毒圈的认识。

　　研究团队揭示了深海柯氏潜铠虾携带的10类病毒（nidovirales、nudiviridae、bunyavirales、hepelivirales、ghabrivirales、jingchuvirales、wolframvirales、picornavirales、qinviridae和articulavirales）。基于深海-浅海间的病毒组比较，他们展现了不同深度海洋生物的病毒组结构的差异以及相似性：在深海柯氏潜铠虾携带的10类病毒中，articulavirales和qinviridae的病毒只在深海软甲纲动物中分布，而其余8类病毒同时被深海和浅海的软甲纲动物携带。此外，研究团队还对病毒和宿主的相互作用进行了描述，例如hepelivirales的病毒在软甲纲动物中表现出一定的宿主限制性。整体而言，这项研究首次报道了深海虾类的病毒组组成，并对深海-浅海生物的病毒组进行了比较分析，有助于扩展人们对海洋病毒遗传多样性、进化、生态学特征的认识。

　　该研究得到国家自然科学基金、中科院分子病毒与免疫重点实验室等的资助。

　　深海和浅海软甲纲病毒组：a.采集的潜铠虾图。b.深海和浅海软甲纲生物样本中发现的病毒种类和数目。深蓝色代表深海，浅蓝色代表浅海。圆中数字代表每类样本中的病毒种类数，括号中数字代表该目或科病毒的条数。c.软甲纲生物宏转录组数据中的病毒种类和分布。上方柱状图为每个测序文库中的reads或非rrnareads数，条形图上方是文库的名称和宿主类型。下方柱状图和折线图展示了每个文库中的病毒种类和丰度，不同颜色代表不同目或科的病毒种类。d.热图展示了不同深度软甲纲宿主和病毒分类之间关系。