uorf自然变异导致大豆磷效率的多样性。
福建农林大学教授廖红/陈志长团队发现并证实位于基因5’utr开放阅读框（uorf）的一个碱基变异导致了大豆群体磷吸收效率水平的多样性。7月1日，相关研究成果以《uorf的自然变异导致大豆磷吸收效率的多样性》为题，发表在《自然—通讯》上。
该研究利用前期收集的大豆磷效率应用核心种质资源，开展了全基因组重测序获得了高密度的分子标记；并开展了田间表型鉴定，获取了磷效率相关的表型指标。他们发现在20号染色体上出现了一个新的显著关联位点。研究者推断该位点不影响根长，是通过影响根的吸收效率从而影响磷的吸收量。为了确定该基因的功能，分别构建了大豆rnai和超表达稳转材料，并进行磷效率表型分析，结果显示该基因影响根的磷吸收效率而不影响总根长；进一步证实了该基因在磷吸收方面的功能。
在研究中，他们解答了各种问题，如位于细胞内质网的蛋白是如何影响根从土壤中吸收磷？gmphf1（sec12-like蛋白的编码基因）的功能变异位点在哪里？最终引起变异的是基因5’utr中哪一个单核苷酸多态性(snp)，还是两个snps同时发挥作用？snp影响下游gmphf1的翻译是否依赖uorf？最终，该研究鉴定到一个uorf的自然变异，该变异影响下游gmphf1的蛋白含量和空间分布，从而影响磷转运蛋白gmpt4从内质网向细胞膜的转移，最终形成大豆群体磷吸收效率的差异。
据悉，福建农林大学副教授郭子龙和生曹红瑞为本文共同第一作者，廖红和陈志长为共同通讯作者。（来源：中国科学报温才妃）
相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41467-022-31555-2
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作者：廖红等 来源：《自然—通讯》
