糖尿病、脂肪肝和肥胖症等代谢性疾病已成为影响人类健康的“杀手”之一。研究显示一些孤儿受体可能成为治疗这些疾病的重要靶点。gpr119又称葡萄糖依赖的促胰岛素受体(glucose-dependent insulinotropic receptor),是g蛋白偶联受体(gpcr)超家族中的一种孤儿受体。由于在糖代谢调控中的作用,gpr119被认为是治疗糖尿病、脂肪肝和肥胖症等代谢性疾病的潜在药物靶点。gpr119主要分布在胰岛β细胞和胃肠道l细胞,调节葡萄糖依赖的促胰岛素的分泌。gpr119的激活可以刺激胰高血糖素样肽-1(glp-1)和葡萄糖依赖性促胰岛素释放多肽(gip)的分泌,这两种激素是调控体内糖代谢平衡的重要物质。 近年来,越来越多的gpr119小分子激动剂被开发,作为开发口服治疗糖尿病的临床药物。然而,对于gpr119功能和激活机制研究的匮乏,限制了靶向gpr119的小分子药物的开发。关于此靶点更深入的分子水平研究成为该领域的热点,而揭示gpr119与内源性配体以及药物分子的相互作用机制成为重要的科学问题。此外,gpr119被认为有较高“自激活”活性,但这种“自激活”的原因和结构基础尚不明确。 8月15日,中国科学院上海药物研究所研究员徐华强、谢欣,联合临港实验室研究员蒋轶,在
structural molecular biology上,发表了最新的研究成果(
structural identification of lysophosphatidylcholines as activating ligands for orphan receptor gpr119)。研究发现,在不加任何外源配体的情况下,gpr119能结合细胞膜中的溶血磷脂酰胆碱(lysophosphatidylcholines,lpc)并被其激活,解释了一些受体的所谓“自激活”现象其实是由未知内源配体导致。研究剖析了gpr119与临床阶段小分子候选药物apd668复合物的冷冻电镜结构,并阐明了受体偶联下游gs信号蛋白的分子机制。 为了探索gpr119的结构,研究从昆虫细胞中表达纯化了人源gpr119受体和gs蛋白三聚体的复合物样品,并在未加入小分子配体的情况下解析了gpr119与gs蛋白的复合物结构,分辨率为3.1埃。结构观察发现,受体的配体结合口袋存在一个狭长的小分子配体密度。为了鉴定该小分子的种类,研究将复合物样品进行质谱分析,结果表明该小分子密度属于具有单链疏水性尾部的溶血磷脂酰胆碱(lpc)。研究进一步在细胞水平验证了不同种类溶血磷脂对gpr119的激活作用,结果显示不同种类的溶血磷脂对gpr119均有不同程度的激活作用。 gpr119的配体结合口袋可以分为两部分——疏水和亲水口袋。其中,疏水口袋贯穿于胞外区和受体中央位置,主要与lpc的疏水性尾部结合;而亲水口袋向胞外区延伸,主要与lpc的亲水性头部结合。gpr119的口袋呈狭长状,在受体中央部位形成一个开口,使得配体结合口袋和细胞膜进行连通。而这个开口的形成与gpr119的跨膜螺旋5(tm5)独特的结构有关。在gpr119的tm5中间位置(5x50)附近,gpr119的氨基酸序列从结构上呈现出与其他class a gpcr相比交错一位的特征,从而形成了独特的开口结构。此开口结构既为较长的单链磷脂提供了结合空间,又提供了另一个潜在的配体入口。借助分子对接的手段,研究认为该开口附近可能构成别构调节剂的结合位点,并探讨了具有控制食欲作用的多糖类天然产物gordonoside f与该别构位点的潜在结合方式。 为了探究高亲和力配体、临床候选小分子药物与gpr119的结合机制,科研人员分析了代表性激动剂apd668与gpr119复合物的结构,分辨率为2.8埃。研究显示,apd668较为刚性的结构骨架主要占据gpr119的疏水口袋,且与该口袋中的氨基酸形成了更强的相互作用,提供配体较高的亲和力。此外,研究表明,gpr119的激活开关(toggle switch)残基w238
6.48呈现与其他受体不同的偏转方式,且在该残基附近发现一个水分子与周围残基形成氢键,稳定了受体的激活构象。 该研究首次报道孤儿受体gpr119偏好性结合lpc的分子机制,提出部分具有“自激活”活性的受体或是结合了未知配体而导致的观点;首次阐释了gpr119与内源性配体lpc以及临床候选小分子药物apd668的结构,揭示了gpr119被小分子激活的结构基础;发现了gpr119独特的结构特征和潜在的别构调节剂的结合位点,为靶向gpr119的代谢性疾病药物开发奠定了重要结构基础。 研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、上海市市级科技重大专项、中科院战略性先导科技专项等的支持,并获得中科院院士、上海药物所研究员蒋华良以及研究员周虎的协助。
图1.gpr119/gs与溶血磷脂酰胆碱(lpc)(a)或临床小分子候选药物apd668(b)复合物的冷冻电镜结构
图2.lpc在gpr119中的结合口袋及关键氨基酸突变对受体活性的影响
研究团队单位:上海药物研究所