8月16日,《美国国家科学院院刊》(pnas)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所/中科院植物分子遗传国家重点实验室谢芳研究组撰写的题为constitutive activation of a nuclear-localized calcium channel complex in medicago truncatula的研究论文。该研究揭示了在植物-微生物共生互作的共生信号途径中核膜定位的钙离子通道蛋白dmi1和cngc15协同编码核钙信号的分子机制,为剖析共生过程钙信号的形成提供了新见解。
钙离子作为重要的第二信使,在真核生物多个信号通路中均发挥重要作用。在豆科植物与根瘤菌或菌根真菌的共生互作过程里,结瘤因子(nod factor,nf)或菌根因子(myc factor,mf)激活的核及核周钙振荡是传递共生信号的核心事件。有效解析共生过程中钙信号的编码机制,相当于解读钙指纹的密码,可协助指导植物作出共生响应,对农业生产的可持续发展意义重大。
在豆科植物与根瘤菌共生固氮体系中,根瘤作为豆科植物特化的、重要的共生固氮器官,受nf信号途径激活而形成;而细胞核钙振荡作为nf信号的早期响应调控着下游共生基因的表达(ehrhard et al., 1996)。在蒺藜苜蓿(m. truncatula)中,dmi1与cngc15是两个定位于核膜的钙离子通道蛋白,参与核及核周钙振荡的形成,且dmi1还可以与cngc15相互作用(charpentier et al., 2016)。然而,共生过程中核钙信号的编码以及dmi1与cngc15如何调控核钙信号形成的机制尚不清楚。
谢芳研究组在蒺藜苜蓿中筛选到一个自发结瘤突变体spd1(spontaneous nodule development 1),即在不接种根瘤菌或nf的情况下植物根部能形成根瘤器官。研究结合遗传分析和基因定位,发现spd1是一个单基因控制的功能获得性突变体,在离子通道蛋白dmi1的羧基端rck2结构域第760位丝氨酸发生了错义突变,即dmi1s760n。遗传实验证明,表达dmi1s760n在野生型植物中,可以在不接种根瘤菌时形成根瘤器官,验证了spd1的自发结瘤表型确是dmi1s760n的突变导致。植物体内细胞钙成像技术检测发现,细胞核钙振荡信号特异的在spd1根部将要形成根瘤的部位被自发激活。rna-seq和qrt-pcr结果进一步表明,由nf及mf信号激活的共生基因在spd1中组成性表达,表明dmi1s760n作为dmi的功能获得性形式自发激活了共生信号途径。
该研究进一步运用结构生物学和遗传学手段阐明dmi1s760n的功能机制,发现dmi1s760n没有改变dmi1的核膜定位以及与cngc15相互作用的能力,但该突变或破坏了dmi1 rck结构域界面的分子间作用力,导致dmi1通道蛋白呈现为组成性激活形式。研究表明,dmi1s760n激活自发结瘤和共生基因表达依赖cngc15的存在,且dmi1的钙离子结合及选择性活性是dmi1s760n激活自发结瘤所必需的。研究利用hek 293t细胞的重组表达系统检测了通道蛋白活性,发现只有共表达dmi1s760n和cngc15才能促进胞内钙离子的内流,并一定程度地介导有规律的钙离子浓度变化。这种效应依赖dmi1门环结构上钙离子的结合和选择性位点以及dmi1和cngc15的离子通道活性。
该研究通过对自发结瘤突变体spd1的研究,揭示了植物-微生物共生互作中钙通道蛋白dmi1激活cngc15的通道活性进而促进共生核钙振荡形成的分子机制。研究工作得到中科院青年科学家基础研究项目、国家重点研发计划、国家自然科学基金、中科院战略性先到科技专项、比尔及梅琳达·盖茨基金会的支持。英国剑桥大学的科研人员参与研究。
植物-微生物共生信号途径中dmi1和cngc15编码核钙振荡的工作模型
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