揭示mrna m5c的序列结构特征和动态变化规律 -凯发k8国际首页登录

　　揭示mrna m5c的序列结构特征和动态变化规律。中山大学生命科学学院教授张锐团队揭示了m5c修饰在哺乳动物细胞系与组织的mrna中的精确定位和动态变化，并表明mrna上的m5c据有独特的序列和结构特征。相关研究5月7日发表在《自然-结构和分子生物学》。

　　奥地利因斯布鲁克医科大学教授alexandra lusser在同期撰写的评述文章getting a hold on cytosine methylation in mrna中，评价张锐团队开发的新计算方法增加了m5c检测的精确度，进一步提供了trna甲基化转移酶nsun2介导mrna甲基化的令人信服的证据。

　　据了解，5-methylcytosine(m5c)修饰广泛存在于trna和rrna中，然而对于mrna上是否存在m5c修饰，学界存在很大的争议。该研究通过分析发现，目前报导的m5c位点往往成簇存在于高gc含量区域，对针对nsun2的rna干扰不敏感，也无法被m5c抗体所富集，极可能是实验引入的假阳性。

　　根据这一特征，该研究建立了一套新颖的生物信息学计算流程过滤噪音，得以精确地定位mrna上的m5c。通过进一步分析，该研究发现nsun2依赖的m5c位点倾向于拥有一个3’富g的基序，通常位于在一个小颈环结构的底部，与其trna底物高度一致，揭示了mrna m5c 序列和结构特征的由来。

　　该研究发现除了nsun2，nsun家族其他成员不调控mrna m5c位点，暗示除了nsun家族成员，可能存在新的甲基转移酶参与了不依赖于nsun2 的mrna m5c位点的催化。通过进一步对7个人类组织于10个小鼠组织的转录组测序分析，分别确认了3212与2498个高置信度位点。结果表明，在不同组织中mrna m5c位点的数量与甲基化水平有很大差异。在人和小鼠的睾丸、肝脏、心肌和骨骼肌，mrna上有数百个高置信度的m5c位点，而在其他的一些组织则寥寥可数。另外，这些m5c位点在人和老鼠之间并不保守，说明它们很可能是受到顺式调控(cis-regulation)的。

　　该研究开发的方法为mrna m5c的研究提供了新的工具;其构建的哺乳动物mrna m5c 精确图谱为发现mrna上m5c修饰的调控和功能奠定了坚实的基础。

　　相关论文信息：https://www..com/articles/s41594-019-0218-x