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研究揭示组蛋白h2a泛素化修饰对核小体的调控机制 -凯发k8国际首页登录

  真核细胞基因组dna被组装形成染色质存储在细胞核中。核小体,作为染色质的基本结构单元,在基因复制与转录过程中高度动态调控。dna/rna聚合酶前的核小体结构要被打开,使得聚合酶能顺利通过核小体,对核小体包裹的dna进行复制转录;而聚合酶通过后的dna要被重新组装形成核小体,保护dna免受损伤,并维持或继承该区域表观遗传信息。组蛋白泛素化修饰,作为一类重要的组蛋白化学修饰方式,在核小体结构的动态调控中发挥至关重要的作用。

  h2a作为最早发现被泛素化修饰的组蛋白,在高等真核生物中,约有5-15%的h2a在高度保守的k119位被单泛素化修饰(ubh2a)。研究发现ubh2a大量富集在不活跃的近着丝粒区、失活的x染色体和沉默的发育基因区域。ubh2a的建立主要依赖多梳复合物(prc)中的ring1b(e3),敲除ring1b能显著降低特点基因启动子附近的ubh2a水平,并导致ubh2a总体水平的显著下降。但是对于ubh2a建立起来后如何调控核小体仍然不清楚。2月5日,中国科学院生物物理研究所李国红、生物物理所客座研究员/首都医科大学陈萍与中国科学院物理研究所李伟合作团队在《美国化学会志》(jacs)上在线发表了题为histone h2a ubiquitination reinforces mechanical stability and asymmetry at thesingle-nucleosome level 的文章,从单分子水平上探讨ubh2a对核小体结构调控的分子机制。

  该研究工作揭示ubh2a本身可以显著增加核小体的稳定性。单分子磁镊研究发现没有泛素化修饰的核小体外圈dna在5pn力下打开,而在ubh2a存在下需要20pn的力;自由能分析发现,核小体外圈dna打开需要消耗自由能32kj/mol;而h2a被泛素化修饰以后,打开核小体外圈dna需要消耗自由能210kj/mol。在增强核小体机械稳定性的同时,荧光共振能量转移fret研究发现ubh2a同时显著增强核小体的盐浓度依赖稳定性。进一步研究发现核小体上的两个ubh2a没有协同作用,其中一个ubh2a分别增强一个核小体外半圈dna稳定性;单分子原位去泛素化分析进一步证实了这一点。利用usp21去泛素化ubh2a核小体,可以恢复核小体的稳定性到未修饰水平。深入机制探讨发现ubh2a上的泛素修饰蛋白通过其位置效应,像栓子一样稳定核小体外圈dna,阻碍dna从核小体上剥离,达到稳定核小体的作用。该研究为后续进一步探讨h2a泛素化修饰与其它蛋白如连接组蛋白h1、prc复合物和fact复合物协同作用机制奠定基础。肖雪、刘翠芳和硕士裴迎新为论文共同第一作者,该研究获得科技部、中科院、国家自然科学基金等的资助。

  图:组蛋白h2a泛素化修饰稳定核小体结构的分子机制


研究团队单位:生物物理研究所
来源:
爱科学

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