昨天,毕业n年参加工作了的大师兄跟我说:明年再拿不到青年,就没机会了!算算到明年申请基金,也就半年的时间了。
我帮师兄整理了几个方向,科研的着力点可以是某类,或者某个生物学过程,抑或某种科研工具,然后组合,解决某种科学问题,给出重要的机制,红花配绿叶的模式,看看都有哪些。
circrna是共价封闭环的新型rna,大家都知道,属于非编码rna(详细介绍《几篇带你迅速入门环状rna研究》)。
大部分的circrna在不同间是保守的,同时其环状结构能抵抗rnase r的降解而比较稳定,可以作为潜在的疾病诊断的标志物。circrna由于其表达的性和调控的复杂性,近些年研究热度很高。
在组研究中,研究思不外乎高通量测序,差异表达分析,选择感兴趣的circrna进行功能研究。
长链非编码rna(long non-coding rna,lncrna)是长度大于 200个核苷酸的非编码 rna。lncrna一直是研究的热点,其作用机制多元,并不像mirna那样具有固定的模式,这也是研究的难点之一,目前高通量测序能检测到的数量为3万多个。
外泌体是一种存在于细胞外的多囊泡体,直径为40-110 nm,其内部包含rna、蛋白质、microrna、dna片段等多种成分,在血液、唾液、尿液、脑脊液和母乳等多种体液中均有分布,获2013年的诺贝尔医学。
外泌体参与的生物学过程包括:①介导肿瘤细胞的增生和干性形成②介导肿瘤微中血管的形成③介导肿瘤细胞的免疫耐受④介导肿瘤细胞的化疗抵抗⑤组分中的mirna参与众多疾病的调控。
“自己吃自己”,这个很多童鞋都知道的,在获得2016年获诺贝尔医学的之前,已经火了很多年了,今年以及明年将应该科研小高峰。
细胞通过对自噬底物的识别、自噬囊泡的形成,再经过与溶酶体的融合,清除老化细胞器以及降解长周期蛋白和异常积聚蛋白。其在在蛋白质的代谢、细胞器更新以及组织发育中有着重要作用,其功能调控直接参与了机体对细胞稳态的维持和对疾病的抵抗。
crispr咱们前面讲的很多了,既有文章专门介绍过,又有在线课程过(《这么做实验,想发低分都难》)
敲除都是很基础的用法了,如果想提升文章的深度和逼格,可以尝试一下基因敲入(knockin),基因干扰(crispr/i)、基因激活(crispr/a)、crispr高通量筛选(screen)等,其在临床疾病上的科研应用非常广泛。
肿瘤等疾病相关数据库,大家比较熟悉有nih旗下的tcga,ncbi旗下的geo等,汇集了全世界范围内高通量测序、芯片检测的数据,其中蕴涵了大量生物信息数据,传统的实验模式很难规模化研究,而基于大数据的生物信息学,可以帮助我们找到有价值有研究意义的,除却了非得做实验的繁琐,而且还提高科研的效率的准确度,在科研分段进行的过程中,数据挖掘找到差异,验证成功后就可以很顺利地开展后续的功能实验、机制研究了。
mirna的热潮基本已过,其主要作为其他研究中的子弹来使用,指哪儿打哪儿,用来挖掘机制调控的幕后大boss。